| Код НЭИКОН | Организация | Янв. 2012 |
| 274 | Национальный университет "Высшая школа экономики" | 935 |
| 297 | Кубанский государственный университет | 364 |
| 185 | Санкт-Петербургский государственный университет | 340 |
| 4237 | Научная библиотека МГУ им. Ломоносова | 305 |
| 4114 | Социологический институт Российской академии наук | 268 |
| 6055 | Московская государственная юридическая академия имени О.Е. Кутафина | 265 |
| 301 | Сибирский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации | 236 |
| 269 | Свердловская областная универсальная научная библиотека им. В.Г.Белинского | 192 |
| 4231 | Научный центр психического здоровья РАМН | 176 |
| 10198 | Новосибирский государственный медицинский университет | 154 |
| 1002 | Астраханский государственный технический университет | 100 |
| 480 | Российская национальная библиотека | 91 |
| 16154 | Амурский государственный университет | 91 |
| 16811 | Федеральный Центр сердца, крови и эндокринологии им. В.А.Алмазова Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации | 88 |
| 342 | Сибирская академия государственной службы | 84 |
| 156 | Российская государственная библиотека | 73 |
| 11510 | Казанский государственный медицинский университет | 69 |
| 6722 | Сибирский федеральный университет | 68 |
| 501 | Челябинский государственный университет | 62 |
| 451 | Институт "Московская высшая школа социальных и экономических наук" | 61 |
| 19281 | Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н.Ельцина | 60 |
| 4439 | Московский городской психолого-педагогический университет | 58 |
| 2924 | Российский кардиологический научно-производственный комплекс Министерство здравоохранения и социального развития Российской Федерации | 57 |
| 5754 | Коми научный центр Уральского отделения Российской академии наук | 57 |
| 13515 | Вятский государственный гуманитарный университет | 54 |
| 4125 | Институт физиологии Коми научного центра Уральского отделения РАН | 52 |
| 856 | Российский университет дружбы народов | 47 |
| 201 | Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации | 45 |
| 313 | Московский государственный институт международных отношений (университет) Министерства иностранных дел Российской Федерации | 43 |
| 223 | Южный федеральный университет | 34 |
| 2692 | Физико-технический институт им. А.Ф. Иоффе РАН | 28 |
| 385 | Новосибирский государственный технический университет | 27 |
| 3242 | Институт цитологии и генетики Сибирского Отделения Российской Академии Наук | 23 |
| 785 | Казанский (Приволжский) федеральный университет | 21 |
| 981 | Национальный исследовательский Томский политехнический университет | 21 |
| 1850 | Южно-Российский государственный технический университет(Новочеркасский политехнический институт) | 20 |
| 497 | Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского | 20 |
| 449 | Воронежский государственный университет | 16 |
| 4288 | Научно-исследовательский институт физиологии Сибирского отделения РАМН | 15 |
| 4127 | Ижевский государственный технический университет | 14 |
| 349 | Санкт-Петербургский государственный политехнический университет | 13 |
| 2540 | Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова Сибирского отделения РАН | 12 |
| 519 | Санкт-Петербургский государственный университет экономики и финансов | 12 |
| 309 | Ставропольский государственный университет | 10 |
| 5764 | Институт органической и физической химии им. А.Е.Арбузова Казанского научного центра РАН | 10 |
| 13588 | Научная педагогическая библиотека им. К.Д.Ушинского | 9 |
| 2520 | Институт проблем химической физики РАН | 8 |
| 963 | Российский государственный педагогический университет им. А. И. Герцена | 7 |
| 403 | Библиотека РАН | 7 |
| 494 | Уфимский государственный авиационный технический университет | 7 |
| 487 | Ростовский государственный медицинский университет Минздравсоцразвития России | 7 |
| 2681 | Институт биофизики клетки РАН | 7 |
| 1258 | Московский Государственный Технический Университет им. Н.Э.Баумана | 6 |
| 3049 | Башкирский государственный аграрный университет | 6 |
| 20946 | Дальневосточный федеральный университет | 5 |
| 1197 | Самарский государственный технический университет | 5 |
| 2683 | Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН | 5 |
| 5962 | Научно-исследовательский институт прикладной акустики | 5 |
| 3210 | Нижегородская государственная медицинская академия | 4 |
| 2301 | Финансовый университет при Правительстве Российской Федерации | 3 |
| 254 | Алтайская краевая универсальная научная библиотека им. В.Я.Шишкова | 2 |
| 19361 | Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова | 2 |
| 894 | Балтийский федеральный университет им. И.Канта | 2 |
| 4093 | Челябинская государственная медицинская академия Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации | 2 |
| 4533 | Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения РАН | 2 |
| 618 | Национальный исследовательский ядерный университет "МИФИ" | 1 |
| 2498 | Институт проблем технологии микроэлектроники и особо чистых материалов РАН | 1 |
| 285 | Донская государственная публичная библиотека | 0 |
| 850 | Новосибирский национальный исследовательский государственный университет | 0 |
| 12153 | Восточно-Сибирская государственная академия культуры и искусств | 0 |
| 16041 | Камчатский государственный университет имени Витуса Беринга | 0 |
| 634 | Кемеровский государственный университет | 0 |
| 16982 | Дагестанский государственный университет | 0 |
| 22322 | Институт теоретической физики им. Л.Д. Ландау РАН | 0 |
| 16199 | Московский государственный горный университе | 0 |
| 15220 | Кубанский государственный технологический университет | 0 |
| 22700 | Мурманский морской биологический институт Кольского научного центра РАН | 0 |
| 5658 | Московский государственный университет тонких химических технологий им. М.В. Ломоносова | 0 |
| 6091 | Костромской государственный технологический университет | 0 |
| 2691 | Институт гидродинамики им. академика М.А.Лаврентьева СО РАН | 0 |
| Всего НЭИКОН | 4894 |